港澳通行证作为内地居民往来香港、澳门特别行政区的法定旅行证件，其签发与管理严格遵循我国出入境管理法律法规体系。关于“在哪里办理”这一核心问题，并非简单的地址查询，其背后涉及明确的法律管辖原则与行政程序规定，公民须依据自身户籍及居住状况，遵循属地管辖的法定要求向特定机关提出申请。
根据现行有效的《中国公民因私事往来香港地区或者澳门地区的暂行管理办法》及相关实施细则，内地居民申请往来港澳通行证及签注，原则上须向其户籍所在地的公安机关出入境管理部门提交申请。此规定确立了“户籍地管辖”的基本原则。公安机关出入境管理部门作为法定主管机关，依法负责受理申请、审核材料、审批签发及制作证件等全流程职责。申请人需亲自或通过符合规定的合法代理方式，向有管辖权的部门提交填写完整的申请表、符合规范的近期证件照片、居民身份证及户口簿等证明本人户籍身份的有效法定文件原件。若申请事由为探亲、商务、就业、就学等，则还需提交与申请事由相对应的其他证明文件，例如亲属关系证明、单位派遣函、入学通知书等，这些材料均需符合法律法规及管理部门的具体形式与实质要求。
随着人口流动日益频繁，为便利长期离开户籍所在地的居民，国家移民管理局在坚持户籍地管辖基本原则的前提下，出台了符合条件的异地办理政策。例如，在非户籍地连续持有有效居住证满规定期限，或符合特定条件的学生、就业人员等，可在其当前居住地的公安机关出入境管理部门申请办理。异地办理并非无条件通行，其适用对象、所需材料（通常包括有效的本地居住证、就业或就学证明等）及可申请的签注类型，可能受限于居住地具体执行政策的约束，与户籍地申请存在程序或材料上的差异。此政策体现了行政便民原则与属地管理原则的平衡。
特别值得注意的是，现役军人、登记备案的国家工作人员等特定身份人员，其办理流程有更为严格的规定，通常必须由所在单位按规定出具同意办理的意见，并遵循指定的管辖机关和内部审批流程，不得随意选择办理地点。
“港澳通行证在哪里办理”的答案，首要法律依据是申请人的户籍所在地。在符合国家明文规定的特定条件下，方可适用居住地异地受理政策。公民在办理前，务必依据自身法律身份（户籍、居住状况、特定身份等），主动确认自身所属的法定管辖机关，并严格按照该机关公布的实时要求备齐全部申请材料。任何试图向无权管辖机关提出申请或材料不全、不实的申请，均无法被依法受理。清晰理解并遵守这些管辖与程序规定，是公民合法、高效行使往来港澳权利的前提，也是出入境管理秩序得以维护的基石。